Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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