Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIC3O95833 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIC3O95833 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms