Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP104O60308 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEP104O60308 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms