Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms