Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TO15178 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TO15178 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TO15178 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms