Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDKO14874 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCKDKO14874 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCKDKO14874 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms