Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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