Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms