Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP17L12C9JPN9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms