Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RGPD3A6NKT7 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms