Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L4A6NEF3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms