Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms