Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX6Q9UNH7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms