Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF18Q9UNG2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms