Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms