Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TDP1Q9NUW8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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