Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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