Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNS3Q9BQ31 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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