Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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SPOCK3Q9BQ16 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SPOCK3Q9BQ16 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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