Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms