Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms