Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms