Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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