Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN23Q96B33 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN23Q96B33 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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