Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms