Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF4BQ92750 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms