Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIBP1Q86W92 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms