Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms