Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTOP1Q7RTM1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms