Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms