Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKDCCQ504Y2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms