Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms