Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms