Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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NRF1Q16656 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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