Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD1Q15327 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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