Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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LAPTM4AQ15012 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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