Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms