Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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