Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNASE1L3Q13609 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms