Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms