Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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