Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2AQ12879 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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