Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms