Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms