Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms