Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms