Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms