Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMF1P82094 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms