Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TUBA4AP68366 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TUBA4AP68366 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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