Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms